脂溢性角化症一般可通过观察随访、物理治疗、手术治疗等方式处理。通常对于一些较小、无不适症状的脂溢性角化症可以先观察，每6-12个月复查一次，看有无变化。
观察随访情况
无症状小皮损：如果脂溢性角化症的皮损较小，没有出现瘙痒、疼痛、破溃等不适症状，且长期没有明显变化，可以选择定期观察。比如直径小于1厘米的、表面平滑的脂溢性角化症，可每隔半年到皮肤科进行检查，观察其大小、颜色、形态等有无改变。稳定皮损：对于那些已经稳定多年，没有异常表现的脂溢性角化症皮损，也可以继续观察，不需要马上处理。
物理治疗方式
冷冻治疗：利用低温液氮使皮损组织坏死脱落。一般一次冷冻可能不够，可能需要多次治疗。冷冻治疗后局部会出现水疱、结痂，大约1-2周结痂脱落，治疗部位要保持清洁干燥，避免感染。适用于较小的脂溢性角化症皮损，比如直径在0.5-1厘米左右的。激光治疗：常用的有二氧化碳激光等。激光可以直接气化皮损组织。治疗后局部会有轻度红肿，可能会有少量渗出，要注意避免沾水，预防感染。一般1-2周创面愈合。对于一些颜色较深或者稍大一点的脂溢性角化症有较好的效果。
手术治疗情况
较大或可疑恶变皮损：如果脂溢性角化症的皮损较大，直径超过1厘米，或者怀疑有恶变倾向，比如短期内迅速增大、颜色加深、出现破溃、出血等情况，就需要进行手术切除。手术切除后需要做病理检查，以明确诊断。手术切除后要注意伤口的护理，按时换药，一般7-10天左右拆线。术后要保持伤口清洁，避免剧烈运动，防止伤口裂开。