霉菌性阴道炎主要由假丝酵母菌引起，治疗通常以抗真菌药物为主，一般7-14天为一个疗程。
药物治疗选择
局部用药：可以使用克霉唑制剂，每晚1粒（500mg），放置阴道内，单次用药即可；也可选用咪康唑制剂，每晚1粒（200mg），连用7天。全身用药：对于不能耐受局部用药、未婚女性及不愿采用局部用药者，可选用口服药物，如氟康唑150mg，顿服。
生活方式调整
保持外阴清洁干燥：每天用温水清洗外阴，勤换内裤，内裤最好用开水烫洗后在阳光下暴晒，以达到杀菌的效果。清洗外阴的盆和毛巾要用开水烫洗，避免交叉感染。避免滥用抗生素：长期大量使用抗生素会抑制阴道内乳酸杆菌的生长，破坏阴道的微生态平衡，从而引发霉菌性阴道炎。所以，在使用抗生素时要严格遵医嘱，不要自行增减药量或延长用药时间。
特殊人群注意事项
孕妇：孕妇患霉菌性阴道炎时，治疗以局部用药为主，禁用口服唑类药物。可选用克霉唑制剂、硝酸咪康唑制剂等局部用药，以缓解症状。治疗时要注意选择对胎儿影响小的药物，且要在医生的指导下进行。糖尿病患者：糖尿病患者由于血糖控制不佳，阴道内糖原含量升高，适合假丝酵母菌生长繁殖，容易反复发作霉菌性阴道炎。这类患者除了要积极治疗阴道炎外，还需要严格控制血糖，将血糖控制在正常范围内，才能减少霉菌性阴道炎的复发。
性伴侣治疗
男性伴侣：男性感染假丝酵母菌后通常无症状，但可能成为传染源，所以如果女性患有霉菌性阴道炎，其性伴侣也需要进行检查和治疗。一般可以让男性使用克霉唑乳膏等局部涂抹，预防女性重复感染。但男性一般不需要口服抗真菌药物，除非有严重的症状。