肾结石体外碎石时，碎石过程疼痛不明显，但碎石后结石排出过程会刺激输尿管，可能引发疼痛。体外碎石通常采用体外冲击波碎石，具体操作是用水囊顶在腰部结石部位，经X射线交叉定位后，将冲击波能量对准结石开启机器碎石。在这一过程中：
一、冲击波只对较大结石释放较大能量，对局部皮肤、肌肉、血管等软组织不释放能量，所以通常不会导致疼痛。但少数情况下，若水囊未贴紧皮肤，冲击波经空气进入组织间隙并释放能量，会使局部皮肤出现红肿疼痛症状，不过多数人可承受。
二、肾结石碎石后结石经输尿管排出，若在输尿管内形成梗阻会引起剧烈疼痛，这多是因结石堆积致输尿管痉挛，使肾盂内压力升高，从而导致患者出现剧烈腰部疼痛症状。
总之，肾结石体外碎石有其特定的操作方式和可能出现的不同情况，要注意碎石中和碎石后的各种表现及应对。