小腹部隐隐作痛持续三天可能由多种原因引起，比如妇科方面的问题，像盆腔炎就比较常见，盆腔炎患者除了小腹痛，还可能伴有阴道分泌物增多等情况；再比如肠道方面的问题，肠炎也会导致小腹部隐痛，肠炎患者可能还会有腹泻、腹胀等表现；另外泌尿系统的问题也不能忽视，如膀胱炎，膀胱炎患者除了小腹痛，可能会有尿频、尿急等症状。
妇科相关原因
盆腔炎：女性盆腔内的器官发生炎症时，就可能出现小腹部隐隐作痛。盆腔炎分为急性和慢性，慢性盆腔炎往往会持续较长时间的隐痛。一般来说，盆腔炎的发生可能与性生活不注意卫生、宫腔操作后感染等有关。如果是盆腔炎导致的小腹痛，需要及时就医，医生可能会根据情况使用抗生素等药物治疗。宫外孕：对于有性生活且月经推迟的女性，小腹部隐痛还得警惕宫外孕。宫外孕是指受精卵在子宫体腔以外着床，常见于输卵管妊娠。宫外孕破裂前可能只是一侧下腹部隐痛或酸胀感，如果发生破裂则会出现剧烈腹痛、阴道出血等严重情况，需要尽快处理。
肠道相关原因
肠炎：饮食不洁是引起肠炎的常见原因之一。比如吃了被细菌、病毒污染的食物后，肠道受到刺激，就会出现小腹部隐痛，同时可能伴有腹泻。如果是细菌感染引起的肠炎，可能需要使用抗生素，但要在医生指导下用药。另外，溃疡性结肠炎也会导致肠道慢性炎症，出现小腹部隐痛，还可能有腹泻、黏液脓血便等症状，这种情况需要长期规范治疗。肠易激综合征：这是一种常见的功能性肠道疾病，精神因素、饮食等都可能诱发。患者会出现小腹部隐痛，疼痛程度一般较轻，还常伴有排便习惯的改变，比如腹泻或便秘，或者腹泻与便秘交替出现。患者要注意调整情绪，避免吃辛辣、油腻等刺激性食物。
泌尿系统相关原因
膀胱炎：女性由于尿道短而直，比较容易发生膀胱炎。膀胱炎主要是细菌感染引起的，除了小腹部隐痛，还会有尿频、尿急、尿痛等膀胱刺激症状。患者需要多喝水，促进排尿，帮助冲洗尿道，同时可能需要使用抗生素治疗。输尿管结石：输尿管结石也可能导致小腹部隐痛，这种疼痛往往比较剧烈，呈阵发性，还可能向会阴部放射。患者可能会伴有血尿等症状。如果结石较小，有可能通过大量饮水、适当运动促进结石排出；如果结石较大，则可能需要进行体外冲击波碎石或手术治疗。