一、生理性原因
（一）月经相关
女性在月经初期或末期，经血量较少，血液在阴道内停留时间较长，血红蛋白被氧化，就会呈现咖啡色。一般这种情况是正常的生理现象，无需特殊处理，注意保持外阴清洁即可。对于青春期女性，由于下丘脑-垂体-卵巢轴尚未完全成熟，月经可能会出现短暂的不规律，包括经色异常；育龄期女性如果月经周期正常，偶尔出现一次咖啡色阴道流血且无其他不适，可能与生活方式改变（如过度劳累、精神压力大等）有关，通过调整生活方式多可恢复。
（二）妊娠相关
1.受精卵着床：部分女性在受精卵着床时，会出现少量阴道流血，一般为咖啡色，持续时间短，通常无其他明显不适。这种情况多见于有正常性生活的生育年龄女性，是受精卵植入子宫内膜时引起的少量出血，属于正常的生理过程。
2.先兆流产：怀孕早期出现咖啡色阴道流血，可能是先兆流产的表现。此时胚胎着床不稳定，可能与胚胎染色体异常、母体黄体功能不足、甲状腺功能减退等因素有关。如果是黄体功能不足导致，可通过补充黄体酮等进行支持治疗，但具体需根据个体情况由医生判断。对于有妊娠计划的女性，出现这种情况应及时就医，进行相关检查，如血hCG（人绒毛膜促性腺激素）、孕酮测定及超声检查等，以评估胚胎状况。
二、病理性原因
（一）妇科炎症
1.阴道炎：如细菌性阴道炎、霉菌性阴道炎等，炎症刺激阴道黏膜，导致阴道黏膜充血、少量出血，血液与阴道分泌物混合后可呈现咖啡色。患者多伴有阴道瘙痒、白带异常等症状。对于细菌性阴道炎，可根据病情使用甲硝唑等药物治疗；霉菌性阴道炎则常用克霉唑等抗真菌药物。不同年龄的女性都可能患阴道炎，青春期女性可能因不注意外阴卫生等原因发病；育龄期女性性生活不注意卫生等易患；围绝经期女性由于雌激素水平下降，阴道抵抗力降低，也容易发生阴道炎。
2.宫颈炎：急性宫颈炎可出现阴道分泌物增多，呈黏液脓性，也可伴有少量阴道流血，表现为咖啡色。慢性宫颈炎多表现为宫颈糜烂样改变，也可能出现接触性出血（如性生活后），血液在阴道内停留后变为咖啡色。宫颈炎的发生与病原体感染有关，如淋病奈瑟菌、沙眼衣原体等。不同年龄女性均可发病，育龄期女性高发，治疗上需根据病原体类型选择相应的抗生素等药物治疗。
（二）宫颈病变
1.宫颈息肉：宫颈息肉是宫颈黏膜的良性增生，息肉表面血管丰富，容易破裂出血，出血量少且缓慢时，血液在阴道内停留变为咖啡色。患者多表现为性生活后少量出血或阴道不规则少量流血。任何年龄的女性都可能患宫颈息肉，通过妇科检查可发现宫颈有息肉样组织，确诊后需行息肉摘除术。
2.宫颈癌：早期宫颈癌可能表现为接触性出血，如性生活后或妇科检查后少量阴道流血，血液可为咖啡色。随着病情进展，阴道流血量可增多，还可伴有阴道排液，有腥臭味。宫颈癌的发生与高危型人乳头瘤病毒（HPV）持续感染密切相关，好发于30-55岁女性。通过宫颈细胞学检查、HPV检测及阴道镜活检等可明确诊断，治疗方法根据临床分期而定，包括手术、放疗、化疗等。
（三）子宫病变
1.子宫内膜炎：子宫内膜炎多由细菌感染引起，炎症导致子宫内膜充血、水肿，可有少量出血，血液混合在白带中呈咖啡色。患者多伴有下腹痛、白带增多等症状。各年龄女性均可发病，产后、流产后女性由于子宫创面未恢复，容易发生子宫内膜炎；育龄期女性性生活不注意卫生等也可引发。治疗主要是使用抗生素抗感染治疗。
2.子宫肌瘤：黏膜下子宫肌瘤可引起子宫收缩不良，导致阴道不规则流血，出血量少且持续时间长时，血液在阴道内氧化变为咖啡色。患者可伴有月经周期缩短、经量增多、下腹坠胀等症状。子宫肌瘤好发于30-50岁女性，根据肌瘤的大小、位置、症状等情况，可选择观察、药物治疗或手术治疗。
3.子宫内膜癌：多见于围绝经期及绝经后女性，主要表现为绝经后阴道不规则流血，量一般不多，早期可为咖啡色。还可伴有阴道排液，若合并感染可有恶臭。通过分段诊刮等可明确诊断，治疗以手术为主，辅以放疗、化疗等。
（四）内分泌失调
1.多囊卵巢综合征：患者由于内分泌紊乱，可出现月经失调，表现为月经稀发、经量少，进而出现咖啡色阴道流血。同时伴有多毛、肥胖、不孕等症状。多见于青春期及育龄期女性，治疗上需调整生活方式，如控制体重、适当运动等，同时根据患者的具体需求（如调经、促排卵等）进行相应的药物治疗。
2.功能失调性子宫出血：多见于青春期和围绝经期女性，由于下丘脑-垂体-卵巢轴功能失调，导致子宫不规则出血，可表现为经量时多时少，经期延长，出血少且持续时间长时可呈咖啡色。治疗需根据患者年龄、病情等选择合适的方法，如止血、调整月经周期等，青春期女性以止血、调整周期、促排卵为主；围绝经期女性以止血、调整周期、减少经量为主。