中医治疗灰指甲可以通过中药外治等方法，比如常用的有浸泡法等。一般来说，中医治疗灰指甲需要一定的时间来起效。
中药外治方法
浸泡法： 可以选用一些具有抗真菌作用的中药进行浸泡。例如，可用蛇床子、地肤子、黄柏、百部等中药煎水后，待水温合适时浸泡患甲，每次浸泡20 - 30分钟左右，每天可进行1 - 2次。这些中药中的有效成分能够渗透进入甲板，抑制真菌的生长。敷贴法： 还可以将一些中药研磨成粉末，调和后制成药膏敷贴在病甲部位。比如把凤仙花捣烂，敷在病甲上，用纱布包扎好，每天更换一次。凤仙花中的某些成分对真菌有一定的抑制作用，通过敷贴的方式让药物持续作用于病甲。
内治法
辨证论治： 根据患者的不同体质和病情进行辨证。如果是湿热蕴结型，可能会出现指甲变色、增厚，伴有肢体困重、口苦口黏等症状，治疗上会采用清热利湿的方法，常用方剂如萆薢渗湿汤加减，其中包含萆薢、薏苡仁、黄柏、茯苓等药物，这些药物协同作用来清除体内的湿热之邪，从而改善灰指甲的状况。如果是血燥风盛型，可能表现为指甲肥厚、干燥，伴有皮肤干燥脱屑等，会采用养血润燥、祛风止痒的方法，方剂可选用当归饮子加减，里面有当归、生地、白芍、防风等药物，起到养血润燥祛风的作用，间接帮助改善灰指甲问题。
配合日常护理
保持足部清洁干燥： 灰指甲患者要注意保持脚部的清洁卫生，每天用温水清洗脚部，洗完后要及时擦干，尤其是脚趾缝之间。因为潮湿的环境容易滋生真菌，加重灰指甲的病情。尽量选择透气好的鞋子和袜子，让脚部能够保持干燥，比如每天更换袜子，鞋子也最好选择棉质、透气性佳的。避免共用生活用品： 灰指甲具有传染性，所以要避免与他人共用拖鞋、脚盆、毛巾等生活用品。家里其他人也要注意检查是否有感染迹象，如果有也要及时进行相应处理，防止交叉感染，导致更多人患上灰指甲。