怀孕40天可以进行流产。以下是具体内容：
一、流产前的准备：
1.彩超检查：必须要通过彩超检查来确认是宫内妊娠，同时清楚了解孕囊大小。
2.确认意愿：明确知晓孕囊大小合适且确定不想要孩子后，才可选择终止妊娠。
二、流产方式的选择：
1.药物流产：如果既往没有生育史和流产史，可选择药物流产。临床观察发现，对首次妊娠进行药物流产的成功率相对高于有孕产史的人，但存在药流不干净的风险，可能需要二次清宫。
2.人工流产：若既往有孕产史、流产史，可选择做人流，包括无痛人流。
三、流产的影响：无论选择哪种流产方式，都会对身体造成一定的伤害。
总之，怀孕40天虽可流产，但要做好相关检查和准备，谨慎选择合适的流产方式，同时要知晓流产对身体存在伤害。