近视眼手术存在一定风险和后遗症，比如术后可能出现干眼问题，据统计，约有10% - 30%的患者在术后一段时间会有不同程度的干眼症状，表现为眼睛干涩、异物感等。
视力回退风险
度数不稳定人群：如果近视患者术前近视度数仍在快速增长，比如每年度数增长超过50度，那么术后有较大可能出现视力回退的情况，也就是手术矫正的视力又下降了。高度近视人群：高度近视患者（近视度数大于600度）进行近视眼手术后，视力回退的风险相对更高一些，因为这类人群眼轴较长等眼部结构特点增加了术后视力不稳定的因素。
感染相关风险
术中感染：在近视眼手术过程中，如果手术室的环境消毒不彻底，或者手术器械消毒不严格等，就有可能引发术中感染。虽然这种情况发生的概率很低，但一旦出现，会严重影响手术效果，可能导致视力下降等严重后果。术后感染：术后如果患者不注意眼部卫生，比如用脏手揉眼睛等，也容易引起眼部感染。术后感染可能会出现眼睛红肿、疼痛加剧、分泌物增多等症状，需要及时就医处理。
角膜相关问题
角膜瓣相关：对于需要制作角膜瓣的近视眼手术，比如LASIK手术，可能会出现角膜瓣移位的情况。如果受到外力撞击等，就有可能导致角膜瓣移位，一旦发生，可能需要再次手术调整。另外，还可能出现角膜瓣皱褶，虽然一般不严重时对视力影响不大，但也会给患者带来眼部不适等问题。角膜雾状混浊：少数患者在近视眼手术后可能会出现角膜雾状混浊，尤其是在术后早期，这可能与手术创伤等因素有关，不过通过一些药物等治疗手段有可能改善，但会影响术后视力的恢复情况。