生殖器上长了一个小豆豆，可能是以下原因引起：
1.毛囊炎：多由金黄色葡萄球菌感染引起。好发于毛发多、汗腺及皮脂腺丰富的部位，如头皮、颈部、胸背、臀部、外阴等。初起为与毛囊口一致的红色充实性丘疹或毛囊性脓疱疮，继而演变成丘疹性脓疱，中间贯穿毛发，四周红晕，有炎症，脓疱干涸或破溃后形成黄痂，痂皮脱落后一般不留瘢痕。
2.传染性软疣：俗称“水猴子”，是一种由痘病毒引起的自身接种性病毒性皮肤病。好发于儿童和青年人，主要通过直接接触传染，也可自体接种。典型损害为受感染局部表皮细胞增生形成的丘疹，直径2-8mm，单发或多发，圆形或半球形，有蜡样光泽，中心脐凹状，并含有干酪样栓塞物，丘疹呈肉色或粉红色。初期质地坚硬，成熟变软，可挤压出干酪样物。
3.尖锐湿疣：由人乳头瘤病毒（HPV）感染所致的以肛门生殖器部位增生性损害为主要表现的性传播疾病。大多发生于18-50岁的中青年人。大约经过半个月至8个月，平均为3个月的潜伏期后发病。此病较为常见，主要通过性接触传播。
4.珍珠状丘疹：又称为珍珠疹，是一种发生在男性冠状沟的丘疹样皮肤病。病因尚未明确，可能与包皮过长、局部卫生状况差、冠状沟分泌物及污垢的长期刺激或其他因素有关。本病不会引起任何不良后果，一般无需治疗。
如果发现生殖器上长了小豆豆，建议及时就医，明确诊断，并在医生的指导下进行治疗。同时，要注意保持局部清洁卫生，避免搔抓和摩擦，避免不洁性生活。