真菌感染的症状表现因感染部位不同而有所差异。比如皮肤真菌感染，常见的体癣，会出现环形红斑，边缘有丘疹、水疱，伴有瘙痒，一般持续数周甚至更久。
皮肤真菌感染症状
体癣表现： 初期为红色丘疹或小水疱，逐渐向周围扩大形成环形或多环形红斑，边界清楚，边缘有丘疹、水疱和脱屑，中央炎症较轻，伴有不同程度的瘙痒。一般好发于面、颈、躯干和四肢等部位。手癣足癣表现： 手癣多从一侧手指开始，初期出现水疱、脱屑，逐渐累及整个手掌，皮肤粗糙、增厚、开裂；足癣分为水疱型、间擦糜烂型和角化过度型，水疱型表现为足底或趾间出现深在性水疱，瘙痒明显；间擦糜烂型常见于趾间，皮肤浸渍发白，去除白皮后露出潮红糜烂面，有恶臭；角化过度型表现为足底、足缘、足跟部皮肤增厚、粗糙、脱屑、干裂。
深部真菌感染症状
肺部真菌感染表现： 症状多样，可为低热、咳嗽、咳痰，痰可为白色黏液痰或脓痰，部分患者有咯血，严重者可出现呼吸困难。免疫功能低下者感染可能更严重，如念珠菌肺炎可伴有高热、寒战等全身症状。消化道真菌感染表现： 口腔念珠菌感染表现为口腔黏膜出现白色膜状物，不易擦去，强行擦去后可见溢血创面，患者有疼痛、吞咽困难；食管念珠菌感染可出现吞咽疼痛、胸骨后疼痛，严重时吞咽困难加重；肠道念珠菌感染可出现腹痛、腹泻，大便可为稀水样或黏液便。
黏膜真菌感染症状
口腔黏膜真菌感染： 除了前面提到的念珠菌感染导致的白色膜状物外，还可能出现黏膜充血、糜烂等情况，影响进食和说话。例如新生儿鹅口疮，就是口腔黏膜的白色真菌感染，多发生在口腔颊黏膜、舌、牙龈等部位。阴道黏膜真菌感染： 常见的是外阴阴道假丝酵母菌病，表现为外阴瘙痒、灼痛，白带增多，呈白色稠厚豆腐渣样。瘙痒症状较为严重，可影响患者的睡眠和日常生活，在月经前后、孕期等免疫力较低时容易发作。