目前并没有所谓“治疗脂肪肝最好的药”，因为脂肪肝的治疗需综合干预，一般以生活方式调整为主，必要时才会使用药物辅助。对于单纯性脂肪肝，通常通过改善生活习惯来控制，比如坚持每周至少150分钟的中等强度有氧运动（像快走、慢跑等）。而对于伴有代谢异常的脂肪肝，可能会用到一些药物。
针对病因的药物干预
调节血脂药物：如果脂肪肝患者伴有高脂血症，可能会用到他汀类药物，它能通过抑制胆固醇合成来降低血脂水平，但使用时要注意监测肝功能等指标。比如，部分他汀类药物可能会对肝脏有一定影响，但在合理监测下可以使用。改善胰岛素抵抗药物：对于合并2型糖尿病或胰岛素抵抗的脂肪肝患者，可能会用到二甲双胍等药物，它可以增加外周组织对葡萄糖的摄取和利用，改善胰岛素抵抗情况，但使用二甲双胍时要注意患者的肾功能等情况，肾功能不全者需谨慎使用。
保肝抗炎药物
多烯磷脂酰胆碱：它可以保护肝细胞膜，参与肝细胞的修复和再生，对于脂肪肝引起的肝损伤有一定的保护作用，能改善患者的肝功能指标，如可以使谷丙转氨酶、谷草转氨酶等有所下降，但它只是辅助改善肝脏炎症等情况，不能替代生活方式的调整。水飞蓟素：具有抗氧化和稳定肝细胞膜的作用，能够减轻脂肪肝导致的肝细胞损伤，有助于改善患者的肝功能，不过也需要在医生指导下使用，并且要注意药物相互作用等问题。
生活方式的基础干预
饮食调整：脂肪肝患者要控制热量摄入，减少高脂肪、高糖食物的摄取，增加蔬菜、水果、全谷物等富含膳食纤维食物的摄入。一般建议每日摄入的脂肪量占总热量的25%以下，碳水化合物占50% - 65%等，通过合理饮食来控制体重和改善代谢。控制体重：肥胖是脂肪肝常见的相关因素，患者要通过饮食和运动来控制体重，争取在3 - 6个月内使体重减轻5% - 10%，例如一个体重80公斤的肥胖脂肪肝患者，可能需要通过合理饮食和运动，在几个月内让体重逐渐下降到相对健康的范围。