第三代试管婴儿成功率受到多种因素影响，一般来说在40% - 60%左右，但这只是一个大致范围，具体情况因个体差异等因素有所不同。
年龄因素影响
年龄是影响第三代试管婴儿成功率的重要因素。女性年龄越小，卵子质量相对越好，成功率相对较高；随着女性年龄增长，尤其是超过35岁后，卵子质量和数量下降，成功率会逐渐降低。男性年龄也会对成功率有一定影响，年龄过大的男性精子质量可能下降。
不孕病因差异
不同的不孕病因也会影响第三代试管婴儿成功率。例如，因输卵管因素导致的不孕，通过第三代试管婴儿的成功率相对可能较高；而由严重的少精、弱精、畸精症等男性因素导致的不孕，或者子宫内膜异位症较严重等情况引起的不孕，成功率可能相对较低。
胚胎质量影响
胚胎质量是关键。优质的胚胎成功率相对更高，胚胎的染色体等情况正常的话，着床和发育成健康胎儿的概率更大；如果胚胎存在染色体异常等问题，即使进行了第三代试管婴儿技术筛选，成功率也会受到影响。
身体整体状况
患者自身的身体整体状况也很重要。如果患者存在其他基础疾病，如高血压、糖尿病等，会对试管婴儿的成功率产生不利影响；而身体状况良好、无其他严重基础疾病的患者，成功率相对更有保障。同时，心理状态也不容忽视，长期的焦虑、紧张等不良心理状态可能会影响内分泌，进而影响试管婴儿的成功率，所以患者保持良好的心态也很关键。