长期窦性心律不齐本身一般不会造成严重后果，但如果是由某些疾病引起的长期窦性心律不齐，可能会有不同影响。比如由冠心病引起的长期窦性心律不齐，可能会导致心肌缺血进一步加重等情况。一般单纯的生理性窦性心律不齐长期存在通常对身体影响较小，但如果是病理性因素导致的长期窦性心律不齐，可能会有以下几方面情况。
对心脏功能的影响
心脏泵血功能受影响： 长期窦性心律不齐可能会在一定程度上干扰心脏的正常节律，影响心脏的有序收缩和舒张，进而影响心脏的泵血功能。虽然单纯生理性的可能影响不明显，但如果是病理性因素导致的，比如存在心肌病变等情况时，长期的心律不齐可能会使心脏泵血效率降低，导致身体各器官供血相对不足。例如，长期的窦性心律不齐可能会让脑部供血偶尔出现小幅度波动，长期积累可能会对脑部的一些功能产生潜在影响。心律失常加重风险： 一些由基础疾病引起的长期窦性心律不齐，可能会使心律失常的情况逐渐加重。比如本身有心肌病的患者，长期窦性心律不齐可能会促使心律失常向更复杂、更严重的类型发展，如发展为心房颤动等更严重的心律失常，进一步影响心脏功能。
对生活质量的影响
引发不适症状： 部分人长期窦性心律不齐可能会出现心悸、胸闷、头晕等不适症状，这些症状会影响日常生活和工作。比如在工作时可能会因为心悸等不适而无法集中精力，影响工作效率；在运动时也可能因为这些症状而不敢进行适当的运动锻炼，从而影响身体健康和生活质量。心理负担加重： 长期受心律不齐相关不适症状的困扰，可能会导致患者产生焦虑、紧张等不良心理情绪。例如，总是担心心律不齐会带来严重后果，长期处于这种心理状态下，会进一步影响身心健康，形成恶性循环，降低生活质量。
与基础疾病的关联影响
加重原发病： 如果长期窦性心律不齐是由其他心脏疾病引起的，如风湿性心脏病、先天性心脏病等，那么它会反过来加重原发病的病情。比如风湿性心脏病患者出现长期窦性心律不齐，会使心脏的病变情况进一步恶化，导致心脏功能逐步减退，病情向更严重的方向发展。增加并发症风险： 长期窦性心律不齐还可能增加一些相关并发症的发生风险。比如因为心脏泵血功能受影响等因素，可能会增加血栓形成的风险，一旦形成血栓，随着血液循环到达其他部位，就可能引发脑栓塞、肺栓塞等严重并发症，对身体健康造成极大危害。