经常半夜胃疼醒来可能有以下原因，相应处理方法如下：
一、饮食习惯：
如果患者有爱吃生冷食物的习惯，这类食物会对胃部黏膜产生刺激，从而引发胃肠道痉挛，导致胃疼。对此，可以通过热敷的方式来帮助缓解，必要时可口服解痉止痛药物如山莨菪碱等。在日常生活中，要尽量减少生冷食物的摄入，以保护胃部健康。
二、胃部疾病：
一般来说，晚上12点左右是胃酸分泌最为旺盛的时候，而如果本身患有胃炎、胃溃疡等基础疾病，此时就容易在晚上引发胃疼。在治疗上，通常可用抑酸药如奥美拉唑来进行缓解。
三、胆囊炎：
胆囊炎患者可能会出现胃部疼痛，这种疼痛有可能是胆囊的炎症所引起的。可口服利胆药物如50%硫酸镁、去氢胆酸片等。
需要注意的是，仅凭此类症状不能准确判断具体原因，还需结合病史特点、其他检查结果等才能做出准确判断，建议在医生指导下明确病因。药物的应用需要严格遵循医嘱，若用药后有不适感应及时停药并就诊。
总结：半夜胃疼醒来的原因多样，包括饮食习惯不良、胃部疾病以及胆囊炎等。要明确具体原因需综合多方面因素，治疗也应根据具体情况选择合适方法，同时药物使用要规范并注意观察不良反应。