婴儿鹅口疮根治可通过药物治疗等方式，一般使用抗真菌药物有一定效果。
药物治疗选择
制霉菌素：可制成混悬液局部涂抹，能抑制白色念珠菌生长。将制霉菌素研成粉末后与鱼肝油调匀，涂搽在婴儿口腔患处。碳酸氢钠溶液：用2%-4%的碳酸氢钠溶液清洗婴儿口腔，每天清洗2-3次，能改变口腔的酸碱度，抑制白色念珠菌繁殖。
日常护理要点
哺乳用具清洁：婴儿使用的奶瓶、奶嘴等用具要定期消毒，可用开水煮沸5-10分钟进行消毒，防止白色念珠菌残留滋生。乳头清洁：母乳喂养的婴儿，妈妈要注意乳头清洁，每次喂奶前后用温水清洗乳头，保持乳头卫生。
增强婴儿抵抗力
合理喂养：保证婴儿营养均衡，对于母乳喂养的婴儿，妈妈要注意自身饮食营养，多摄入富含蛋白质、维生素等营养物质的食物；对于人工喂养的婴儿，要按照正确的冲调比例喂养配方奶，保证婴儿获取充足营养。保持口腔卫生：在婴儿进食后，可以喂少量温水，起到清洁口腔的作用，帮助清除口腔内残留的奶液等物质，降低鹅口疮发生的风险。