血栓通胶囊具有活血祛瘀，通脉活络的作用，可用于脑络瘀阻引起的中风偏瘫，心脉瘀阻引起的胸痹心痛；脑梗塞、冠心病心绞痛见上述证候者。一般来说，它在改善血液循环等方面有一定应用。
对血液循环的作用
改善血液流变学：血栓通胶囊能降低全血黏度，抑制血小板聚集，从而改善血液的流变性，让血液流动更顺畅。比如在一些研究中发现，服用血栓通胶囊后，全血比黏度等指标会有所改善。增加脑血流量：对于因脑络瘀阻导致的情况，它可以增加脑血流量，改善脑部的血液供应。有相关实验表明，给药后能使脑血流量有明显的增加趋势。
对心血管系统的作用
减轻心肌缺血损伤：当存在心脉瘀阻时，血栓通胶囊能够减轻心肌缺血再灌注损伤，保护心肌细胞。通过动物实验可以观察到，服用血栓通胶囊的实验组心肌缺血程度相对较轻，心肌细胞损伤情况有所缓解。调节血管内皮功能：它可以调节血管内皮细胞的功能，促进血管内皮舒张因子的释放，维持血管的正常张力和舒缩功能，有助于心血管系统的稳定。
在脑血管疾病中的应用
辅助治疗脑梗塞：在脑梗塞的治疗中，血栓通胶囊可作为辅助用药。它能通过改善脑部血液循环，促进脑梗塞患者神经功能的恢复。临床观察发现，配合血栓通胶囊治疗的脑梗塞患者，在神经功能缺损评分等方面有一定程度的改善。降低脑血管疾病复发风险：长期服用血栓通胶囊可能有助于降低脑血管疾病的复发风险。因为它持续发挥改善血液流变学等作用，维持脑部血液的良好状态，减少脑血管再次发生事件的几率。
在眼科疾病中的应用
治疗视网膜中央静脉阻塞：对于视网膜中央静脉阻塞患者，血栓通胶囊也有一定疗效。它可以促进视网膜的血液循环，改善视网膜的缺血状态，有助于提高患者的视力，改善眼底病变情况。研究显示，服用血栓通胶囊的患者视网膜的血流灌注等指标会得到一定程度的改善。