男性感染支原体后，部分人可能没有明显症状，而有症状者主要表现为泌尿生殖系统相关症状。比如约有30%~40%的男性非淋菌性尿道炎患者是由支原体感染引起，主要症状有尿道刺痛，伴有不同程度的尿急、尿频、尿痛，尿道外口轻度红肿，分泌物稀薄，量少，为浆液性或脓性，多需用力挤压尿道才见分泌物溢出。
泌尿生殖系统症状表现
尿道炎症状： 男性感染支原体后引发尿道炎时，尿道会有瘙痒感，有时候还会出现灼烧样疼痛，在晨起时可能会发现尿道口有少量稀薄的黏性分泌物，部分人症状较轻，容易被忽视。前列腺炎症状： 若支原体感染波及前列腺，可能会出现会阴部胀痛、尿频、尿急、尿不尽等症状，还可能影响精液质量，对生育产生一定影响，不过这种情况相对尿道炎来说发生率稍低，但也不容忽视。
其他可能出现的症状
呼吸道感染相关： 如果是支原体引起的呼吸道感染，男性可能会有咳嗽症状，多为刺激性干咳，可持续较长时间，有的还伴有发热，体温可在38℃左右，部分人还会感觉乏力、头痛等，但这相对泌尿生殖系统感染来说，是支原体感染的另一种情况，不过如果男性有密切接触呼吸道支原体感染患者的情况，也需要考虑这种可能。附睾炎症状： 少数情况下，支原体感染可能会引发附睾炎，表现为阴囊部位疼痛、肿胀，触摸时疼痛明显，严重时会影响睾丸的正常功能。
症状出现的时间差异
潜伏期： 支原体感染后有一定潜伏期，一般为1~3周，所以即使接触了感染源，也可能在1~3周后才出现症状，这就需要男性在有高危性行为等情况后，注意观察自身身体变化，如果超过3周仍有异常不适，应及时就医检查。