奥硝唑胶囊主要用于治疗由厌氧菌感染引起的多种疾病。例如，它可用于腹部感染，像腹膜炎、腹内脓肿等；还能用于盆腔感染，如子宫内膜炎、子宫肌炎、输卵管或卵巢脓肿、盆腔软组织感染、嗜血杆菌阴道炎等；口腔感染方面，如牙周炎、根尖周炎等；以及外科感染，如伤口感染、表皮脓肿、褥疮溃疡感染、蜂窝组织炎、气性坏疽等。
用于腹部感染的情况
腹膜炎： 由细菌感染、化学刺激或损伤等引起的腹膜炎症，奥硝唑胶囊能针对其中的厌氧菌发挥抗菌作用，帮助控制感染。腹内脓肿： 腹腔内某一间隙或部位因组织坏死液化，被肠曲、内脏、网膜或肠系膜等包裹，形成局限性脓液积聚，奥硝唑胶囊可参与清除厌氧菌相关的感染病灶。
用于盆腔感染的情形
子宫内膜炎： 细菌突破宫颈的防御侵入子宫内膜而发生炎症，奥硝唑胶囊对其中的厌氧菌有抑制和杀灭作用。子宫肌炎： 炎症累及子宫肌层，奥硝唑胶囊可通过作用于厌氧菌，缓解炎症带来的不适，促进病情恢复。
用于口腔感染的状况
牙周炎： 是发生在牙周组织的慢性炎症，厌氧菌在牙周炎的发病中起到一定作用，奥硝唑胶囊能对厌氧菌产生作用，辅助治疗牙周炎。根尖周炎： 牙齿根尖周围组织的炎症性疾病，厌氧菌感染是常见病因之一，奥硝唑胶囊可用于对抗相关的厌氧菌感染，减轻根尖周炎症状。
用于外科感染的情况
伤口感染： 皮肤或黏膜破损后，厌氧菌等可能侵入引发感染，奥硝唑胶囊可帮助抑制厌氧菌，促进伤口感染的好转。表皮脓肿： 皮肤表皮下的脓肿，若存在厌氧菌感染，奥硝唑胶囊能发挥抗菌功效，助力脓肿的治疗。