卵巢巧克力囊肿通常可以治愈，其治疗目标包括减轻疼痛、缩小及去除病灶等，可运用非甾体抗炎药、激素类药物、保留生育功能手术、保留卵巢功能手术、根治性手术等方式来进行治疗。
一、非甾体抗炎药：在疾病引发腹痛或痛经时，可先运用此类药物来缓解疼痛症状，可在医生指导下服用如布洛芬缓释胶囊、对乙酰氨基酚片、美洛昔康片等。这些药物能够通过抑制前列腺素合成，起到镇痛抗炎的作用。
二、激素类药物：对于病情相对较轻的情况，可以通过调理体内激素来治疗，遵医嘱服用醋酸甲羟孕酮片、达那唑胶囊、孕三烯酮胶囊等药物。它们可以通过调节激素水平，抑制异位内膜的生长。
三、保留生育功能手术：针对年轻且有生育需求的患者，通常需要保留生育功能，即保留子宫和一侧或双侧卵巢，通过手术切除或破坏所见到的异位内膜病灶，然后进行粘连分离，恢复正常解剖结构。这种手术方式能在去除病灶的同时，尽量保留患者的生育能力。
四、保留卵巢功能手术：如果患者没有生育需求，则可采取这种手术，将盆腔内病灶及子宫切除，同时保留一侧或部分卵巢。这样既能去除病灶，又能在一定程度上保留卵巢功能。
五、根治性手术：对于病情较为严重或无生育需求的患者，可采取根治性手术切除，即切除子宫、双附件。能较为彻底地解决问题。
建议在确诊疾病并有明显症状后，应及时前往医院就诊，积极配合医生进行相应治疗，并按要求定期复查。
总结：卵巢巧克力囊肿的治疗方法多样，要根据患者的具体情况如年龄、生育需求、病情严重程度等来选择合适的治疗方式，治疗后需遵医嘱定期复查，以监测病情变化和治疗效果。