鲍温样丘疹病主要与人乳头瘤病毒（HPV）感染有关，其中高危型HPV的16型和18型感染较为常见。据相关研究，约70%的鲍温样丘疹病患者可检测到HPV16型感染。
病毒感染因素
HPV传播途径： 性行为是HPV传播的主要途径。如果与感染了高危型HPV的性伴侣发生无保护性行为，就有可能感染HPV，进而引发鲍温样丘疹病。比如在性生活开始较早、性伴侣较多的人群中，鲍温样丘疹病的发病风险相对更高。病毒持续感染： 人体感染HPV后，如果病毒持续存在，就可能逐渐导致皮肤细胞异常增生，从而形成鲍温样丘疹病。一般来说，从HPV感染到出现明显的鲍温样丘疹病皮损，可能需要数月甚至数年的时间。
免疫功能因素
免疫功能低下者： 当人体免疫功能较弱时，比如患有艾滋病等免疫缺陷疾病的患者，或者长期使用免疫抑制剂的人群，身体对HPV的清除能力下降，就更容易受到HPV感染，并且感染后也更难自行清除病毒，从而增加了患鲍温样丘疹病的几率。例如，艾滋病患者由于免疫系统受损，感染HPV后发生鲍温样丘疹病等相关病变的风险显著高于正常人。老年人免疫衰退： 随着年龄增长，老年人的免疫功能会逐渐衰退，对HPV的抵御能力降低，也可能更容易患上鲍温样丘疹病。有统计数据显示，50岁以上人群中鲍温样丘疹病的发病相对较为常见。
其他相关因素
皮肤局部刺激： 一些皮肤局部的慢性刺激也可能在HPV感染引发鲍温样丘疹病的过程中起到一定协同作用。比如长期摩擦、紫外线照射等因素，可能会损伤皮肤黏膜，使皮肤的防御功能下降，从而让HPV更容易感染皮肤细胞并导致病变。长期从事户外工作，皮肤经常暴露在阳光下且受到摩擦的人群，相对而言患鲍温样丘疹病的风险可能会有所增加。遗传易感性： 虽然目前关于鲍温样丘疹病的遗传易感性研究还不是特别充分，但有部分研究提示，个体的遗传背景可能会影响其对HPV感染的易感性以及病变的发展过程。某些特定基因的多态性可能会使一些人更容易患上鲍温样丘疹病。不过具体的遗传机制还需要进一步深入研究来明确。