关键点：睡觉醒来腋下疼的原因包括淋巴结炎、毛囊炎、雌激素水平变化，可分别通过应用药物、手术、调整生活习惯等方式治疗。
一、淋巴结炎：
这通常是由金黄色葡萄球菌或溶血性链球菌感染引起。当腋下淋巴结区域遭受炎症刺激时，就可能引发局部红肿、疼痛等表现。针对此情况，一般可在医生指导下使用头孢克肟胶囊、阿莫西林胶囊、罗红霉素片等药物进行医治。
二、毛囊炎：
多是由于皮肤外伤、毛囊损伤等因素所致，会致使患者出现皮肤瘙痒、疼痛等症状。如果症状较为严重，形成了痈或疖，那么建议通过手术切开病灶的方式来排除脓肿，以此来实现缓解症状的目的。
三、雌激素水平变化：
女性若过度劳累、睡眠不足或过量进食刺激性食物，可能会引发体内雌激素水平的变动，使得副乳疼痛并牵扯到腋下，从而产生疼痛症状。对此，建议患者及时调整生活作息，保证充足的休息，同时也可以适度进行运动，以促进身体的新陈代谢。
总结概况提示：睡觉醒来腋下疼可能有多种原因，明确具体原因后可采取相应的治疗措施，包括药物治疗、手术及生活习惯调整等。