清胃黄连丸和黄连清胃丸的区别主要体现在以下几个方面：
1.成分不同：清胃黄连丸主要成分包括黄连、石膏、桔梗、甘草、知母、玄参、地黄、牡丹皮、天花粉、连翘、栀子、黄柏、黄芩、赤芍；黄连清胃丸主要成分包括黄连、栀子、连翘、石膏、知母、玄参、天花粉、防风、荆芥穗、白芷、薄荷、黄芩、大黄、桔梗、黄柏、牵牛子（炒）、枳实（炒）、旋覆花、甘草。
2.功效不同：清胃黄连丸主要具有清胃泻火、解毒消肿的功效；黄连清胃丸主要具有清胃泻火、解毒通便的功效。
3.适用病症不同：清胃黄连丸主要用于治疗肺胃火盛所致的口舌生疮、齿龈、咽喉肿痛；黄连清胃丸主要用于治疗口舌生疮、牙龈肿痛、胃热牙痛、暴发火眼。
4.不良反应不同：清胃黄连丸和黄连清胃丸的不良反应尚不明确。
5.注意事项不同：清胃黄连丸和黄连清胃丸的注意事项相同，包括孕妇慎用；忌烟、酒及辛辣、油腻食物；不宜在服药期间同时服用滋补性中药；脾胃虚寒者慎用；按照用法用量服用，儿童、哺乳期妇女、年老体弱及脾虚便溏者应在医师指导下服用；服药3天症状无缓解，应去医院就诊；对本品过敏者禁用，过敏体质者慎用；本品性状发生改变时禁止使用；儿童必须在成人监护下使用；请将本品放在儿童不能接触的地方；如正在使用其他药品，使用本品前请咨询医师或药师。
需要注意的是，以上内容仅供参考。如需使用清胃黄连丸或黄连清胃丸，建议在医生的指导下进行，以确保用药安全有效。