嘴边起小水疱的原因多样，主要有以下这些：
一、从中医角度来看，可能是近期食用过多刺激性食物或压力过大等引发上火导致，常伴有小便黄、眼睛红肿疼痛等症状。
二、也可能是由一些疾病引起：
1.口角炎：这是一种发生于上下唇交界位置的皮肤炎症，可由维生素缺乏、感染、接触过敏物质等原因造成。会出现单侧或双侧口角红肿、皲裂、疼痛，还可能有小水疱，即表现为嘴边起小水疱。治疗上可通过湿敷生理盐水、醋酸氯己定溶液等。
(1)维生素缺乏：比如缺乏维生素B2等。
(2)感染：如细菌等感染。
(3)接触过敏物质：接触到某些导致过敏的物质。
2.单纯疱疹：由单纯疱疹病毒感染引起，好发于口周，可出现局部红肿、聚集性水疱等症状，即表现为嘴边起小水疱，进一步发展会形成溃疡。症状严重时可口服阿昔洛韦片等抗病毒药物进行治疗。
3.脓疱疮：这是一种由细菌感染引起的皮肤病，当嘴边发生感染时，表现为红斑基础上的水疱，即出现嘴边起小水疱，之后转变为脓疱，脓疱破裂后形成蜜黄色结痂。可通过局部外用莫匹罗星软膏、夫西地酸乳膏等进行治疗，水疱较大时需将内容物抽出。
三、若有蚊虫叮咬史，还需考虑丘疹性荨麻疹的可能。
总之，导致嘴边起小水疱的原因较多，若患者自觉症状严重，应前往医院诊断治疗，同时要注意避免抠挠以免继发感染。