射精时会痛可能由多种原因引起。比如，当男性患有尿道炎时，大约有20% - 30%的患者在射精时会出现疼痛。
一、生殖系统感染因素
1. 前列腺炎：前列腺炎是导致射精痛的常见原因之一。当前列腺发生炎症时，前列腺组织充血、水肿，在射精过程中，前列腺平滑肌收缩，会刺激周围神经，从而引起疼痛。一般来说，慢性前列腺炎患者更容易出现这种情况，炎症会持续存在，影响射精时的正常生理过程。2. 精囊炎：精囊炎通常是由细菌感染引起的。精囊发生炎症后，精囊壁会变得敏感，射精时精囊收缩，就会引发疼痛。精囊炎患者除了射精痛外，还可能伴有血精现象，这是因为炎症导致精囊内的血管破裂出血，血液混入精液中。
二、结石相关因素
1. 尿道结石：如果尿道内存在结石，在射精时，精液通过尿道排出，结石会阻碍精液的顺利通过，并且刺激尿道黏膜，导致射精时疼痛。尿道结石可能是由肾脏或膀胱的结石掉落至尿道引起的，这种疼痛往往比较剧烈，患者能明显感觉到尿道部位的不适。2. 精囊结石：精囊结石相对较少见，但一旦出现也会导致射精痛。精囊结石会引起精囊的梗阻和炎症反应，使得射精时精囊的正常收缩受到影响，从而产生疼痛。
三、性生活相关因素
1. 性生活不节制：过度频繁的性生活会使生殖器官长时间处于充血状态，比如频繁手淫或者性生活次数过多，都会导致生殖系统反复充血，容易引发射精痛。一般建议性生活频率要适度，成年男性一周性生活次数保持在2 - 3次较为合适，避免过度劳累生殖器官。2. 性交动作粗暴：在性生活过程中，如果性交动作过于粗暴，会对生殖器官造成机械性损伤，比如用力过猛撞击到生殖器官等，在射精时就会出现疼痛。这种情况通常在性生活后很快就能感觉到疼痛，而且可能会伴有局部的损伤表现，如红肿等。