吃一次避孕药对身体的影响因人而异，但一般来说，偶尔吃一次短效口服避孕药，对健康的短期影响相对较小。不过，紧急避孕药不能作为常规避孕方法，一个月经周期内最好只吃一次，一年内服用最好不超过3次。
对月经周期的影响
可能导致月经紊乱： 吃一次紧急避孕药后，约有10%的人可能出现月经提前或推迟的情况。比如，原本规律的月经周期可能会被打乱，提前来月经或者推迟几天来。短效避孕药对月经影响较小： 如果是规律服用短效口服避孕药，它还可能对月经有一定的调节作用，让月经变得更规律，减少经量等。但如果是偶尔吃一次，可能不会有这样的调节效果，反而可能引起短期的紊乱。
对内分泌的影响
短期内分泌波动： 无论是紧急避孕药还是短效避孕药，都含有激素成分。吃一次避孕药后，会引起体内激素水平的短期波动。比如，紧急避孕药中的高剂量激素可能会影响雌激素和孕激素的平衡，这种波动一般在1 - 2个月内会逐渐恢复，但可能会出现恶心、呕吐等类似早孕的反应，这就是激素影响内分泌导致的。长期影响相对有限： 不过，单次服用避孕药引起的内分泌波动通常是短暂的，身体一般能够自行调整回来，不会对长期内分泌造成严重且不可逆的损害，但频繁服用会增加这种内分泌紊乱的风险。
对肠胃的影响
可能引起肠胃不适： 部分人吃了避孕药后会出现肠胃不适的症状，比如恶心。吃紧急避孕药时，约有20%的人可能会出现恶心的情况，一般发生在服药后的几个小时内，有的持续时间较短，几个小时后就会缓解，而有的可能会持续1 - 2天。个体差异明显： 当然，也不是所有人吃一次避孕药都会有肠胃不适，这存在明显的个体差异。有些人对避孕药中的激素成分耐受性较好，吃了之后不会有明显的肠胃反应，而有些人则比较敏感，就容易出现恶心等不适症状。