疱疹性咽峡炎主要由肠道病毒引起，治疗方面，一般来说，病程具有自限性，大多在1周左右可自愈，但也可通过一些措施来缓解症状。
对症治疗缓解不适
退热： 如果患者体温超过38.5℃，可使用对乙酰氨基酚等药物进行退热，这类药物能通过抑制前列腺素合成来发挥退热作用。缓解咽痛： 对于咽痛明显的患者，可以使用含漱液，如生理盐水含漱来减轻局部不适，也可酌情使用冰硼散等药物来缓解咽部疼痛，但要注意儿童使用时需谨慎，避免误吞。
抗病毒药物的使用情况
常用药物： 目前对于疱疹性咽峡炎的抗病毒治疗，常用的药物有干扰素α等。干扰素α具有抗病毒活性，能抑制病毒复制。特殊情况： 一般来说，大多数轻症患者不需要常规使用抗病毒药物，因为该病是自限性疾病，但对于重症患者或有免疫缺陷的患者，可能需要在医生评估下使用抗病毒药物。
日常护理很重要
隔离休息： 患者需要隔离休息7 - 10天左右，避免交叉感染，因为肠道病毒具有传染性，隔离能防止将病毒传播给他人。饮食调整： 患病期间要给予清淡、易消化的饮食，如小米粥、软面条等，避免食用辛辣、刺激性食物，以免加重咽部不适。同时要保证充足的水分摄入，每天饮水量应在1000 - 1500毫升左右，有助于缓解发热引起的脱水情况，也利于毒素排出。口腔护理： 保持口腔清洁，饭后用温水漱口，学龄前儿童可以由家长帮助漱口，防止口腔细菌滋生，促进病情恢复。
预防并发症的要点
密切观察病情： 要密切观察患者的病情变化，如体温、精神状态等。如果患者出现持续高热不退、精神萎靡、呕吐、头痛等症状，要及时就医，因为少数患者可能会出现脑炎、心肌炎等并发症，需要及时发现并处理。增强免疫力： 在病情恢复后，要注意让患者适当进行体育锻炼，如每天进行30分钟左右的散步等轻体力活动，以增强机体免疫力，减少复发的可能。同时要保证充足的睡眠，一般儿童需要保证10 - 12小时的睡眠时间，成人也需要7 - 8小时的充足睡眠，良好的睡眠有助于身体恢复和免疫力提升。