乙肝疫苗全程接种共3针，按照0、1、6个月程序，即接种第1针疫苗后，间隔1及6个月注射第2及第3针疫苗。
新生儿接种乙肝疫苗要求与成年人有所不同。正常足月新生儿出生后24小时内接种乙肝疫苗，接种部位为大腿前部外侧肌肉，接种剂量为10微克。如果新生儿体重低于2000克，应在出生后尽早接种乙肝疫苗，但在体重达到2000克后，再按上述程序接种第2针和第3针乙肝疫苗。
与成年人不同，新生儿对乙肝疫苗的免疫反应较差，尤其是早产、低体重儿以及有宫内感染的新生儿。因此，对于这些新生儿，需要增加接种的针次。如果母亲为乙肝病毒携带者，新生儿在出生后12小时内还需接种乙肝免疫球蛋白。
需要注意的是，接种乙肝疫苗后，可能会出现接种部位红肿、疼痛、发热、乏力等不良反应，一般不需要特殊处理，可自行缓解。如果出现严重不良反应，应及时就医。此外，接种乙肝疫苗后，需要定期检测乙肝五项，以了解接种效果。如果乙肝表面抗体滴度小于10国际单位/毫升，需要加强接种乙肝疫苗。