治疗小儿结膜炎的药物有很多，具体用药需要根据病因和症状来选择，以下是一些常用的药物：
1.抗病毒药物：如果小儿结膜炎是由病毒感染引起的，医生可能会开一些抗病毒药物，如利巴韦林滴眼液、阿昔洛韦滴眼液等。这些药物可以抑制病毒的复制，缓解症状。
2.抗生素药物：如果小儿结膜炎是由细菌感染引起的，医生可能会开一些抗生素药物，如妥布霉素滴眼液、左氧氟沙星滴眼液等。这些药物可以杀死细菌，控制感染。
3.糖皮质激素药物：如果小儿结膜炎症状比较严重，医生可能会开一些糖皮质激素药物，如泼尼松龙滴眼液。这些药物可以减轻炎症反应，但使用时间不宜过长，以免引起眼压升高。
4.人工泪液：如果小儿结膜炎导致眼睛干涩不适，医生可能会开一些人工泪液，如玻璃酸钠滴眼液。这些药物可以滋润眼睛，缓解不适。
需要注意的是，以上药物均需要在医生的指导下使用，家长不能自行给孩子用药。另外，在使用药物期间，家长应注意观察孩子的症状是否缓解，如有加重应及时就医。同时，要注意孩子的眼部卫生，避免用手揉搓眼睛，勤洗手，避免与他人共用毛巾、脸盆等。