HPV感染后多数人没有明显症状，少部分人可能出现生殖器部位的异常表现。比如，女性感染高危型HPV后，持续感染可能引发宫颈病变，但早期也可能无症状。而低危型HPV感染可能会导致生殖器疣，一般在感染后数周~数月发病，生殖器部位会出现乳头状、菜花状、鸡冠状的赘生物，大小不一，可能单个存在，也可能多个聚集。
生殖器疣相关表现
皮肤型HPV疣： 常见的有寻常疣，多发生在手部等皮肤部位，表现为表面粗糙的丘疹，质地较硬。还有跖疣，发生在足底，受压时会有疼痛，表面粗糙，边界清楚，周围有稍高的角质环。黏膜型HPV疣： 生殖器部位的黏膜型疣就是前面说的生殖器疣，除了菜花状等外观，有的可能比较小，呈颗粒状。而且生殖器疣可能会逐渐增多、增大，还可能伴有瘙痒等不适。
宫颈病变相关表现
早期宫颈病变： 感染高危型HPV引发宫颈病变早期，很多人没有明显自觉症状，可能只是在妇科检查做TCT（液基薄层细胞检测）和HPV检测时发现异常。进展期宫颈病变： 当宫颈病变进展到一定程度，可能会出现阴道不规则出血，比如性交后出血、绝经后阴道出血等；还可能出现阴道分泌物增多，分泌物可能呈白色、血性，有异味等情况。
其他部位HPV感染表现
口腔或咽喉部HPV感染： 比较少见，可能会出现口腔或咽喉部位的赘生物，不过相对来说发生率很低。一般是通过口交等高危行为感染，会有局部的异常新生物表现。呼吸道乳头瘤病： 婴幼儿可能会发生呼吸道乳头瘤病，由HPV6或HPV11感染引起，表现为呼吸道阻塞症状，如呼吸困难、喘息等，不过这也是比较罕见的情况。