大部分肉芽肿难以自愈，不过也有一小部分肉芽肿有自愈的可能，像部分嗜酸性肉芽肿就存在自愈的情况，但这种几率是比较小的。倘若肉芽肿长时间都没有自愈，或者出现病情持续加重的现象，那通常就需要采用物理治疗、药物治疗以及手术治疗等手段了。
一、物理治疗：
1.对于水肿性肉芽肿，可以运用高渗盐水在局部进行湿敷，以此形成高渗环境，从而将肉芽肿中的水分抽吸出来，进而减轻水肿状况，助力肉芽肿的愈合。
2.还能够使用硝酸银对肉芽肿进行烧灼，直至达到皮肤创面以下，防止肉芽肿再度生长。
二、药物治疗：
1.若肉芽肿是由感染因素引发的，那就需要运用抗生素药物来进行有规律的治疗，包括青霉素类抗生素如阿莫西林，甚至还可能要用到抗厌氧菌的药物，比如甲硝唑、替硝唑等。
2.要是患者的肉芽肿是由结核杆菌感染所导致的，还能够在医生的指导下，使用利福平等抗结核药物展开治疗。
三、手术切除：
可以直接把突出于伤口表面的肉芽肿切除掉，接着用干净的纱布或棉签进行压迫止血，并在伤口局部皮肤上外用生理盐水覆盖，以促进伤口的愈合。
总之，肉芽肿是否能自愈存在不确定性，当不能自愈且情况不佳时，可根据具体情况选择合适的治疗方法来处理。