阿戈美拉汀是一种用于治疗抑郁症的药物，它也有一些副作用。一般来说，大约有1/5的患者在使用阿戈美拉汀过程中可能会出现一些不良反应。
常见的神经系统副作用
头痛： 部分患者在服用阿戈美拉汀后可能会出现头痛症状，一般程度较轻，但也有少数人头痛较为明显。头晕： 服用该药后，有些患者会感觉头晕，影响日常的活动和工作，尤其是在需要高度集中注意力的情况下，如驾驶等，头晕可能会带来安全隐患。
代谢相关副作用
体重变化： 可能会出现体重增加的情况，这是因为阿戈美拉汀对代谢有一定影响，具体机制与药物影响了身体的能量代谢等有关。血清转氨酶升高： 有少部分患者在用药后会出现血清转氨酶升高的现象，虽然大多数是轻度且可逆的，但也需要定期监测肝功能，如果升高较为明显则需要考虑调整用药。
消化系统副作用
恶心： 部分患者会出现恶心的感觉，一般在用药初期比较常见，随着用药时间的延长，有些患者的恶心症状会逐渐减轻，但也有一些人会一直存在轻度恶心的情况。腹泻： 个别患者可能会出现腹泻症状，若腹泻较严重，可能会导致身体脱水等问题，需要注意补充水分。
其他可能的副作用
嗜睡： 有患者服用阿戈美拉汀后会感觉嗜睡，影响白天的精神状态，比如在学习或工作时容易犯困。性功能影响： 少数患者可能会出现性功能方面的变化，不过具体的发生情况因人而异，有些患者可能会发现性欲降低等情况，但这并不是所有患者都会出现的普遍现象。