肝区疼痛可能由多种原因引起，比如约有15%~20%的病毒性肝炎患者会出现肝区疼痛，疼痛时间可能持续数小时到数天不等。
肝脏疾病导致
病毒性肝炎：像乙肝、丙肝等病毒性肝炎，病毒会侵袭肝脏，引起肝细胞炎症、肿胀，导致肝包膜受到牵拉，从而出现肝区疼痛，同时可能伴有乏力、食欲减退、黄疸等症状。肝脓肿：细菌等病原体感染肝脏形成脓肿，脓肿会刺激周围组织，引发肝区持续或间歇性疼痛，还常伴有高热、寒战等全身感染症状，体温可能高达39℃~40℃。
胆道系统问题
胆囊炎：胆囊发生炎症时，炎症刺激会牵涉到肝区疼痛，疼痛多在进食油腻食物后发作，可向右肩部放射，还可能伴有恶心、呕吐等症状。胆结石：胆结石移动时可能卡住胆管，引起胆管痉挛，导致肝区隐痛或绞痛，疼痛程度有时较为剧烈，还可能伴有黄疸、发热等表现。
其他可能因素
肝脏淤血：右心衰竭等疾病可导致肝脏淤血，使肝脏体积增大，牵拉肝包膜引起肝区胀痛，同时有右心衰竭的相关表现，如下肢水肿、呼吸困难等。外伤：腹部受到撞击等外伤时，可能导致肝脏受损，出现肝区疼痛，受伤部位通常有明显的外伤痕迹，还可能伴有内出血的表现，如面色苍白、血压下降等。