厌氧菌感染的症状因感染部位不同而有所差异。比如口腔厌氧菌感染时，可能会出现口臭、牙龈红肿、疼痛等症状，严重的还可能有化脓现象。
口腔部位厌氧菌感染症状
牙龈部位： 会有明显的红肿，用手触碰时容易出血，还可能伴有疼痛，部分患者能看到牙龈上有小的化脓点。口腔整体： 口气会比较重，有难闻的臭味，这是因为厌氧菌在口腔内代谢产生了特殊的物质。
腹腔部位厌氧菌感染症状
腹部疼痛： 通常是持续性的隐痛或者胀痛，疼痛部位多与感染的腹腔器官相关，比如阑尾部位感染时右下腹疼痛明显。消化系统反应： 可能出现恶心、呕吐的症状，还会影响食欲，导致进食减少。严重时可能伴有发热，体温可升高至38℃~39℃左右。
女性生殖系统厌氧菌感染症状
阴道分泌物异常： 会出现白带增多的情况，白带的颜色可能发黄，质地变得黏稠，而且有特殊的腥臭味。外阴不适： 外阴会有瘙痒感，尤其是在夜晚瘙痒会更加明显，部分患者还可能出现外阴红肿的现象。
肺部厌氧菌感染症状
咳嗽咳痰： 咳嗽较为频繁，痰液一般比较黏稠，颜色可能为黄色或者黄绿色，严重时痰中可能带有血丝。呼吸方面： 可能会有呼吸急促的表现，尤其是在活动后，严重的肺部厌氧菌感染还可能导致发热，体温波动在37.5℃~39℃之间。