新生儿拉肚子通常由消化不良、肠道菌群失调、肠炎等情况导致，应依据具体原因，在医生指导下进行用药治疗，具体如下：
一、消化不良：新生儿的消化能力相对较弱，易出现消化不良从而引发拉肚子现象。对此可使用如下药物进行治疗：
1.四磨汤口服液：能顺气降逆、消积止痛等。
2.蒙脱石散：有收敛止泻的作用。
3.双歧杆菌：可调节肠道菌群。
二、肠道菌群失调：肠道内有害细菌增多时，可能会引起拉肚子，可给予如下药物：
1.益生菌，比如布拉氏酵母菌：可改善肠道微生态。
2.枯草杆菌二联活菌颗粒：有助于调节肠道功能。同时结合蒙脱石散进行止泻治疗。
三、肠炎：肠道遭受细菌感染会导致拉肚子，可给予以下药物：
1.头孢克洛颗粒：起到抗菌作用。
2.蒙脱石散：帮助止泻。
3.布拉氏酵母菌：调节肠道菌群。若腹泻较为严重，还需通过静脉滴注来补充葡萄糖、氯化钾等，以防脱水和电解质紊乱。
总之，当新生儿出现拉肚子情况时，不可自行随意用药，应及时就医，由医生明确具体原因后给予合适的治疗方案。