储存脐带血主要是因为其中含有造血干细胞，这些干细胞可用于治疗多种疾病。例如，在血液病治疗方面，脐带血中的造血干细胞能重建患者的造血和免疫系统，像白血病等血液系统疾病，约有1/3的患者会选择使用脐带血进行移植治疗。
血液系统疾病治疗
白血病治疗： 对于一些类型的白血病，如急性淋巴细胞白血病等，脐带血造血干细胞移植是重要的治疗手段之一。通过移植脐带血中的造血干细胞，可以帮助患者重新建立正常的造血功能和免疫功能，从而对抗白血病细胞。地中海贫血治疗： 地中海贫血患者需要长期依赖输血和去铁治疗来维持生命，而脐带血造血干细胞移植如果匹配成功，能够从根本上治愈地中海贫血，让患者摆脱对长期输血和去铁治疗的依赖。
免疫系统疾病治疗
重症联合免疫缺陷病： 这是一种先天性的免疫系统疾病，患者几乎没有正常的免疫功能。脐带血造血干细胞移植可以为这类患者提供具有正常免疫功能的造血干细胞，帮助他们重建免疫系统，使患者能够抵御各种病原体的侵袭。噬血细胞综合征治疗： 噬血细胞综合征是一种较为严重的免疫系统异常疾病，病情进展迅速。脐带血造血干细胞移植在合适的情况下可以有效治疗噬血细胞综合征，控制病情的发展，挽救患者的生命。
其他疾病治疗
代谢性疾病治疗： 某些遗传代谢性疾病，如黏多糖贮积症等，也可以通过脐带血造血干细胞移植来进行治疗。造血干细胞移植后，能够提供正常的酶等物质，纠正代谢异常的状况。神经母细胞瘤治疗： 在神经母细胞瘤的治疗中，部分患者也会采用脐带血造血干细胞移植的方法，尤其是在大剂量化疗后进行移植，有助于患者恢复造血功能，并进一步清除肿瘤细胞，提高治疗效果。