吃一次紧急避孕药可能会带来一些危害，比如可能会导致月经紊乱，一般在服用后1~2周内可能出现撤退性出血，部分人服药后月经周期会改变，提前或推迟。
对内分泌的影响
激素水平波动：紧急避孕药含有高剂量的孕激素，服用后会影响体内正常的激素平衡。它会干扰下丘脑-垂体-卵巢轴的功能，导致雌激素和孕激素的分泌紊乱。例如，可能使促黄体生成素、促卵泡生成素等激素的分泌出现异常，进而影响排卵等生理过程。长期影响隐患：虽然偶尔吃一次紧急避孕药不一定会造成严重且长期的内分泌失调，但频繁使用会大大增加这种风险。不过单次服用相对来说，短期内可能主要表现为激素水平的短暂波动。
对胃肠道的影响
恶心呕吐反应：约有一部分人在服用紧急避孕药后会出现恶心的症状，严重的可能会呕吐。一般发生在服药后的几小时内，这是因为药物刺激了胃肠道，影响了胃肠的正常蠕动和消化功能。比如，有的女性服药后1~2小时就会感觉恶心，甚至把药物吐出来，这时候药物的避孕效果可能会受到影响。肠胃不适持续时间：这种恶心呕吐的症状通常持续时间较短，大多在1天内会缓解，但也有个别人可能会持续1~2天。不过一般不会对肠胃造成长期的器质性损伤，只是服药当时会有不适感觉。
对身体其他方面的影响
头晕乏力情况：部分人服用紧急避孕药后会出现头晕、乏力的现象。这是因为药物进入人体后，对神经系统产生一定影响，导致身体处于相对虚弱的状态。比如有的女性服药后整天感觉头晕沉沉的，没有精神，活动后乏力感更明显，这种情况一般会在1~2天内逐渐减轻消失。乳房胀痛表现：少数人可能会出现乳房胀痛的情况，这也是药物影响激素水平带来的结果。乳房组织对激素变化比较敏感，激素波动会引起乳房腺体的短暂增生，从而导致胀痛，一般持续几天会自行缓解。