多囊卵巢综合症患者怀孕后，对胎儿可能存在一定影响，比如约有15% - 30%的多囊卵巢综合症孕妇可能发生妊娠期糖尿病，这比正常孕妇的发生率要高。
胎儿发育方面的影响
胎儿生长受限风险： 多囊卵巢综合症孕妇体内的激素环境可能不利于胎儿的营养吸收和正常生长，有研究发现，部分多囊卵巢综合症孕妇所生胎儿出现胎儿生长受限的概率相对正常孕妇有所增加。比如一些追踪研究显示，约5% - 10%的多囊卵巢综合症孕妇会出现胎儿生长受限情况。先天畸形风险： 有研究表明，多囊卵巢综合症孕妇所生胎儿发生某些先天畸形的风险可能略有升高，不过总体来说风险并不是特别高。例如神经管畸形等方面，相对正常人群有一定程度的上升，但具体机制还在进一步研究中。
孕妇自身并发症对胎儿的间接影响
妊娠期高血压疾病： 多囊卵巢综合症孕妇发生妊娠期高血压疾病的几率较高，而妊娠期高血压疾病会影响胎盘的血液灌注，进而影响胎儿的氧气和营养供应。数据显示，多囊卵巢综合症孕妇发生妊娠期高血压疾病的概率比正常孕妇高2 - 3倍左右，这会间接对胎儿的生长发育产生不良影响，可能导致胎儿宫内发育迟缓等问题。早产风险： 多囊卵巢综合症孕妇发生早产的风险也相对较高。一方面是因为孕妇自身存在的内分泌紊乱等问题影响子宫内环境，另一方面可能与妊娠期并发症有关。有统计发现，多囊卵巢综合症孕妇早产发生率比正常人群高出约10% - 15%，早产可能会导致胎儿出现一系列健康问题，如呼吸系统发育不成熟等。
产后对胎儿的影响
婴儿代谢问题： 多囊卵巢综合症孕妇所生婴儿在出生后，发生代谢综合征相关问题的风险可能增加。因为母亲孕期的激素环境可能会对婴儿的代谢编程产生影响，未来这些婴儿可能在儿童期甚至成年后更容易出现肥胖、胰岛素抵抗等代谢方面的问题。例如有研究追踪发现，这类婴儿到儿童期时，发生肥胖的概率比正常婴儿高约20%左右。