龟头炎的常用药物有抗生素类、抗真菌类等。一般来说，针对不同病因的龟头炎，用药不同。
抗生素类药物
细菌性龟头炎常用药：如果是细菌感染引起的龟头炎，常用莫匹罗星软膏。莫匹罗星是局部外用抗生素，能抑制细菌蛋白质合成，从而发挥抗菌作用。另外，对于病情较重的细菌性龟头炎，可能会口服抗生素，如头孢克洛等，它属于头孢菌素类抗生素，通过抑制细菌细胞壁的合成来杀菌。
抗真菌类药物
念珠菌性龟头炎常用药：要是念珠菌感染导致的龟头炎，常用克霉唑乳膏。克霉唑能抑制真菌细胞膜的合成，影响其代谢过程。还有酮康唑乳膏也可用于念珠菌性龟头炎，它同样是通过干扰真菌细胞色素P450的活性，从而抑制真菌细胞膜主要固醇类-麦角固醇的生物合成。
糖皮质激素类药物
伴有过敏等情况的用药：对于一些伴有过敏、炎症较重的龟头炎，可能会短期使用糖皮质激素类药物，如氢化可的松软膏。但这类药物不能长期大面积使用，因为长期使用可能会引起皮肤萎缩、毛细血管扩张等不良反应。不过短期应用在控制炎症方面有一定作用，比如因局部刺激等因素引起的渗出明显的龟头炎，可短期用糖皮质激素减轻炎症反应。但使用时必须在医生指导下，严格掌握适应证和使用时间。需要注意的是，不同病因引起的龟头炎用药不同，而且在用药前最好先明确病因，比如通过分泌物涂片等检查来确定是细菌、真菌还是其他病原体感染等情况，然后针对性用药。同时，在用药过程中要注意保持局部清洁卫生，避免刺激，治疗期间避免性生活等。