脑彩超与脑CT存在较大区别，主要体现在成像原理、检查目的以及辐射程度这三方面。
一、成像原理：
1.脑彩超是利用声波成像，通过声波来检查。
2.脑CT则是借助X射线断层扫描来成像。
二、检查目的：
1.脑彩超的超声波穿透力有限，主要通过颅缝来检查颅内血管情况，如大脑前、中、后动脉等，可观察脑血管是否存在狭窄、畸形、斑块及其大小、体积、软硬程度等，能辅助诊断癫痫、脑梗死、脑出血等疾病以及新生儿颅脑疾病。
2.CT的X射线能穿透颅骨，可清晰显示颅骨结构以及颅内脑实质结构，如肿瘤、占位、炎症、血管病等问题，能辅助诊断脑外伤、脑瘤、脑梗死、脑出血、脑萎缩、脑积水等众多疾病。
三、辐射程度：
1.脑彩超无辐射。
2.脑CT的X射线有辐射，不过通常辐射剂量较小，一般不会对人体造成伤害。
脑彩超与脑CT适用于不同的情形，需要医生依据患者病情进行选择，合适的检查可为医生提供有力的诊断依据、证据和线索，为医生的诊断及制定治疗方案提供资料，以便医生做出更优的治疗决策。