甲硝唑氯化钠注射液主要用于治疗厌氧菌感染等情况。它对大多数厌氧菌，如拟杆菌属、梭杆菌属、梭状芽孢杆菌属等有强大的抗菌作用。
治疗厌氧菌感染相关
腹腔感染的治疗： 腹腔内的厌氧菌感染是常见病症，甲硝唑氯化钠注射液能有效抑制腹腔内厌氧菌的生长繁殖，帮助控制感染。比如在一些因阑尾炎穿孔导致的腹腔感染患者中，使用该药物可以发挥抗菌功效。盆腔感染的治疗： 女性盆腔感染常常有厌氧菌参与，甲硝唑氯化钠注射液可用于此类感染的治疗，帮助缓解盆腔感染引发的相关症状，像腹痛、发热等情况可能会因药物对厌氧菌的抑制而得到改善。
治疗原虫感染方面
阴道毛滴虫病： 甲硝唑氯化钠注射液对阴道毛滴虫有杀灭作用，可用于治疗女性的阴道毛滴虫病。它能直接作用于阴道毛滴虫，抑制其生长繁殖，从而减轻阴道毛滴虫感染引起的阴道瘙痒、白带异常等症状。肠阿米巴病： 对于肠阿米巴病，甲硝唑氯化钠注射液也有一定的治疗作用。它可以杀灭肠道内的阿米巴原虫，帮助患者缓解因肠阿米巴感染导致的腹泻、腹痛等症状。
预防术后厌氧菌感染
腹部手术患者： 腹部手术患者存在发生厌氧菌感染的风险，在术前、术中或术后使用甲硝唑氯化钠注射液可以起到预防厌氧菌感染的作用。例如胃肠道手术患者，通过使用该药物能降低术后切口感染、腹腔感染等由厌氧菌引起的并发症的发生几率。妇科手术患者： 妇科手术患者同样面临厌氧菌感染的可能，甲硝唑氯化钠注射液可用于预防妇科手术中的厌氧菌感染，保障手术患者的术后恢复顺利，减少感染相关的不良情况发生。