在做爱时，当伴侣深入时，肚子内部疼痛可能由以下原因引起：
1.生理原因：
性行为过程中，男性的动作过于剧烈，可能导致女性腹部受到刺激，从而引起疼痛。
女性在做爱时，由于缺乏性知识或性经验不足，可能会因为紧张、焦虑等情绪，导致腹部肌肉紧张，引起疼痛。
2.病理原因：
女性可能患有子宫内膜异位症、盆腔炎或盆腔粘连等疾病，这些疾病可能导致做爱时肚子内部疼痛。
女性的阴道或子宫颈存在病变，如阴道炎、宫颈炎或子宫颈息肉等，也可能引起做爱时肚子内部疼痛。
做爱时动作过于激烈，可能导致女性腹部受到撞击或挤压，从而引起腹部内部组织损伤，导致疼痛。
如果做爱时肚子内部疼痛的情况持续存在或频繁发生，建议及时就医，进行详细的检查和诊断，以确定具体的原因，并采取相应的治疗措施。