骨囊肿的治疗需根据具体情况而定，一般较小的骨囊肿有自愈可能，若囊肿较大或有症状则需干预。
手术治疗方式
刮除植骨术：这是常用的手术方法，通过刮除囊肿内的病变组织，然后植入自体或异体骨来促进骨修复。对于一些简单的骨囊肿，此方法效果较好。微创开窗术：相对传统刮除术创伤更小，在囊肿部位开窗，刮除内容物后填充生物材料，减少对周围正常骨组织的破坏。
非手术治疗情况
观察随访：对于一些无症状且较小的骨囊肿，尤其是儿童处于生长发育阶段的骨囊肿，可定期进行X线等检查观察，部分可能会自行愈合。比如直径小于2厘米且没有明显症状的骨囊肿，可以每3 - 6个月复查一次X线，观察囊肿变化。石膏固定：如果骨囊肿发生在一些活动较少的部位，且患者情况特殊不适合手术时，可考虑石膏固定等保守方式，但这种情况相对较少。
不同人群的治疗特点
儿童患者：儿童骨囊肿有一定特殊性，因为儿童骨骼还在发育。如果是年龄较小的儿童骨囊肿，若囊肿较小且无症状，更多倾向于观察随访，因为儿童骨骼有自我修复潜力。而如果囊肿较大影响骨骼生长发育，则可能需要尽早手术干预。成人患者：成人骨囊肿一般自愈可能性较小，若有疼痛等症状或囊肿有增大趋势，多建议手术治疗，如刮除植骨术等。