治疗生殖疱疹的药物有很多，以下是一些常用的药物：
1.抗病毒药物：阿昔洛韦、伐昔洛韦、泛昔洛韦等。这些药物可以抑制病毒的复制，减轻症状，缩短病程。
阿昔洛韦是一种嘌呤核苷类似物，对单纯疱疹病毒、水痘带状疱疹病毒等有抑制作用。一般口服，一次0.2g，一日5次，或者一次0.4g，一日3次，疗程7~10天。
伐昔洛韦是阿昔洛韦的前体药物，口服后在体内迅速转化为阿昔洛韦，抗病毒作用比阿昔洛韦强，不良反应较少。一般口服，一次0.3g，一日2次，疗程7~10天。
泛昔洛韦是喷昔洛韦的前体药物，口服后在体内转化为喷昔洛韦，对单纯疱疹病毒、水痘带状疱疹病毒等有抑制作用。一般口服，一次0.25g，一日3次，疗程7~10天。
2.免疫调节剂：干扰素、转移因子、胸腺肽等。这些药物可以调节机体的免疫功能，增强抗病毒能力，减少复发。
干扰素是一种具有抗病毒、抗肿瘤和免疫调节作用的细胞因子。可以肌肉注射、皮下注射或局部注射，一般每周3次，每次300~500万单位，疗程2~6个月。
转移因子是从健康人白细胞中提取的一种多核苷酸和低分子量肽，可将供体的细胞免疫活性转移给受体，使其获得免疫功能。一般肌肉注射，一次1~2mg，一周1~2次，疗程3~6个月。
胸腺肽是从胸腺中提取的一种具有生物活性的多肽，可促进T细胞分化、成熟，增强NK细胞活性，提高机体免疫力。一般肌肉注射或皮下注射，一次10~20mg，一日1次，疗程3~6个月。
3.中药：龙胆泻肝丸、知柏地黄丸、除湿胃苓汤等。这些中药可以清热解毒、祛湿止痒、活血化瘀，对生殖疱疹有一定的治疗作用。
龙胆泻肝丸是由龙胆草、黄芩、栀子、泽泻、木通、车前子、当归、地黄、柴胡、甘草等中药组成的方剂。具有清肝胆、利湿热的功效。可用于治疗肝胆湿热所致的头晕目赤、耳鸣耳聋、胁痛口苦、尿赤、湿热带下等症。
知柏地黄丸是由知母、黄柏、熟地黄、山茱萸、牡丹皮、山药、茯苓、泽泻等中药组成的方剂。具有滋阴降火的功效。可用于治疗阴虚火旺所致的潮热盗汗、口干咽痛、耳鸣遗精、小便短赤等症。
除湿胃苓汤是由苍术、厚朴、陈皮、猪苓、泽泻、白术、赤茯苓、滑石、防风、栀子、肉桂等中药组成的方剂。具有健脾燥湿、清热利湿的功效。可用于治疗脾湿下注所致的湿疹、瘙痒、水疱、糜烂等症。
需要注意的是，生殖疱疹是一种性传播疾病，容易复发，需要长期治疗。在治疗期间，应避免性生活，同时注意个人卫生，保持局部清洁干燥，避免感染。此外，还应避免饮酒、吸烟、熬夜等不良生活习惯，加强锻炼，提高免疫力。如果症状加重或出现新的症状，应及时就医。