头孢氨苄甲氧苄啶胶囊主要用于敏感菌引起的多种感染。一般来说，它对革兰阳性菌和部分革兰阴性菌有较好的抗菌作用。
用于呼吸道感染
敏感菌引发的咽炎：当由敏感菌导致咽部出现炎症时，头孢氨苄甲氧苄啶胶囊可发挥作用，能抑制细菌的生长繁殖，帮助缓解咽部的不适症状。敏感菌引起的扁桃体炎：对于因敏感菌感染导致的扁桃体发炎情况，该药物可以通过抑制细菌相关代谢过程，起到抗菌消炎的效果，减轻扁桃体的红肿、疼痛等症状。
用于泌尿系统感染
敏感菌所致尿道炎：当尿道受到敏感菌感染引发炎症时，头孢氨苄甲氧苄啶胶囊能够针对感染的敏感菌进行作用，抑制其生长，从而缓解尿道炎引起的尿频、尿急、尿痛等症状。敏感菌造成的膀胱炎：在敏感菌引起膀胱炎时，此药物可对膀胱内的敏感菌产生抗菌效应，控制感染进一步发展，减轻膀胱炎带来的排尿异常等不适。
用于皮肤软组织感染
敏感菌导致的疖肿：对于由敏感菌引起的疖肿，头孢氨苄甲氧苄啶胶囊可以通过抗菌作用，抑制疖肿部位细菌的繁殖，帮助疖肿逐渐消退。敏感菌引发的蜂窝织炎：当皮肤软组织因敏感菌感染出现蜂窝织炎时，该药物能对感染的敏感菌发挥作用，减轻蜂窝织炎部位的红肿、热痛等炎症表现。需要注意的是，使用该药物前需明确是否对头孢菌素类药物等过敏，有青霉素过敏性休克史者慎用。而且儿童、孕妇、哺乳期妇女等特殊人群使用时需格外谨慎，应在医生的指导下权衡利弊后使用。