直肠炎的治疗需根据具体病情来定，一般来说，轻度直肠炎可通过药物等治疗在较短时间内改善，而重度可能需要综合处理。
药物治疗选择
氨基水杨酸制剂： 如柳氮磺吡啶，适用于轻、中度直肠炎。它能抑制炎症介质的产生，减轻直肠炎症反应。糖皮质激素： 对于病情较重的直肠炎，可局部使用糖皮质激素，像氢化可的松保留灌肠，能快速减轻炎症水肿，但长期使用可能有一些副作用，需在医生严密监测下使用。益生菌： 直肠炎患者肠道菌群可能失调，适当补充益生菌，如双歧杆菌等，有助于调节肠道菌群，辅助改善直肠炎症状态。
生活方式调整
饮食方面： 要避免食用辛辣、油腻、刺激性食物，比如辣椒、油炸食品等，这些食物会刺激直肠黏膜，加重炎症。同时，应增加膳食纤维的摄入，像全麦面包、新鲜蔬菜（如西兰花、胡萝卜等），每天保证摄入足够的膳食纤维，约25~35克左右，有助于保持大便通畅，减少对直肠的刺激。作息规律： 保持充足的睡眠，每天尽量保证7~8小时的睡眠时间，良好的作息有助于身体的自我修复，对直肠炎的恢复有积极作用。另外，要避免过度劳累，劳累会影响身体的免疫力，不利于炎症的消退。
病因针对性治疗
感染性直肠炎： 如果是细菌感染引起的直肠炎，需要根据药敏试验选择敏感的抗生素进行治疗。例如大肠杆菌感染，可能会选用喹诺酮类抗生素，但要注意儿童等特殊人群的用药禁忌，儿童一般不首选喹诺酮类药物。如果是病毒感染引起的直肠炎，主要是进行对症支持治疗，因为目前针对病毒感染并没有特效的抗病毒药物直接针对直肠炎进行治疗，主要是缓解腹泻、腹痛等症状。放射性直肠炎： 对于放疗引起的放射性直肠炎，要注意在放疗过程中采取一些防护措施，放疗后要密切观察直肠情况。可以使用一些黏膜保护剂来促进受损黏膜的修复。