治灰指甲常用的药物主要有口服抗真菌药，比如伊曲康唑、特比萘芬等。一般来说，口服抗真菌药治疗灰指甲需要一定的疗程，通常伊曲康唑采用冲击疗法，服用1周停3周为一个疗程，可能需要2-3个疗程；特比萘芬则一般需要连续服用3个月左右。
口服抗真菌药的种类
伊曲康唑： 它是一种合成的三氮唑衍生物，可抑制真菌细胞色素P450酶，从而干扰真菌麦角固醇的合成，达到抗真菌的作用。服用时需配合餐食，以促进药物吸收。特比萘芬： 能特异性地抑制真菌角鲨烯环氧化酶，使真菌细胞膜形成过程中角鲨烯堆积，导致真菌细胞死亡。它可以空腹服用，生物利用度较高。
外用抗真菌药辅助治疗
阿莫罗芬搽剂： 属于局部外用抗真菌药，它可以通过抑制真菌细胞膜麦角固醇的合成来发挥抗真菌作用。每周使用1-2次，连续使用几个月，能改善灰指甲的状况。但涂抹时要注意只用于病甲，避免接触周围正常皮肤。环吡酮胺乳膏： 能改变真菌细胞膜的完整性，影响真菌细胞的代谢过程，从而起到抗真菌的效果。可以直接涂抹在病甲及周围皮肤，一天使用1-2次。
用药时的注意事项
肝功能不全者需谨慎： 伊曲康唑和特比萘芬都主要通过肝脏代谢，肝功能不全的患者使用时要密切监测肝功能指标，如发现肝功能异常应及时就医调整用药。孕妇及哺乳期女性： 这两类口服抗真菌药都不建议孕妇和哺乳期女性使用，以免对胎儿或婴儿造成不良影响，如有灰指甲问题需在医生指导下选择其他安全的处理方式。儿童用药： 儿童使用治疗灰指甲的口服抗真菌药要非常慎重，一般不建议儿童常规使用口服抗真菌药治疗灰指甲，除非病情非常严重且经过严格评估。