检测男性生殖器是否感染HPV的常见方法包括基因分型定量检测、细胞检查和醋酸白试验。具体如下：
一、基因分型定量检测：
1.这是用于判断病情的一种方式。
2.医生在进行检查时，会使用专用取样器刷取包皮内外的脱落细胞。
3.通过化验可得到人乳头瘤病毒的分型和定量结果。
二、细胞检查：
1.可借此来判断病情。
2.当有疣体存在时，能对患病组织进行病理检查。
3.在显微镜下，尖锐湿疣上皮会呈现乳头状瘤样增生，上皮内可见具有特征性的挖空细胞，有时细胞质内还能看到因病毒导致的变性颗粒。
三、醋酸白试验：
1.通过该试验来检查状况。
2.将浓度为3%至5%的冰醋酸溶液涂抹在尖锐湿疣患者的患病部位，如阴茎、龟头或男性肛周部位。
3.若尖锐湿疣受损部位则会呈现白色可见，亚临床感染区会是均匀清晰的白色区域，容易识别。
综上所述，当疣出现时病理检查是可靠方法，当疣未出现时基因分型定量检测结果最为准确，且该检测方法误差较小。