性生活后小便刺痛的原因包括以下方面：
一、可能是性交过程中用力过度、姿势不当或初次性交等原因，造成尿道或女性阴道损伤、男性龟头损伤等，排尿时尿液刺激损伤创口从而引发疼痛。
二、也可能是由于以下疾病导致：
1.尿路感染：女性尿路较短以及男性包皮过长都可能诱发尿路感染。同时，如果卫生习惯不良，或者患有慢性前列腺炎等疾病，龟头、阴道中存在大量致病菌，在无保护措施的情况下，也容易引发尿路感染，进而出现性生活后小便刺痛。具体表现为，女性尿路较短，易受病菌侵袭；男性包皮过长，易藏污纳垢。卫生习惯不佳，如不注意清洁私密部位等。患有慢性前列腺炎等疾病，使致病菌滋生。
2.龟头炎：龟头乃至包皮发生炎症反应，性交后龟头受到刺激，男性就会出现小便刺痛，还伴随龟头红肿、疼痛等症状。若女性性交时未使用保护措施，炎症累及尿道，也可导致性生活后小便刺痛。例如，龟头和包皮出现炎症，性交后产生刺激反应。女性未进行保护，炎症蔓延至尿道。
3.阴道炎：性生活后小便刺痛还可能见于阴道炎，有时性交女性也会出现疼痛，还伴随阴道瘙痒、异味，以及阴道分泌物较多等症状。当合并尿道感染时，还会有尿频、尿急、下腹部不适等症状，严重时甚至会出现血尿。如阴道炎会导致各种相关症状，包括阴道不适等。合并尿道感染时会有更多泌尿系统的表现。
出现性生活后小便刺痛症状后建议就医治疗，可以遵医嘱服用头孢菌素、青霉素等抗生素类药物，以及热淋清颗粒、龙金通淋胶囊等中成药来改善不适症状。日常生活中要注意性生活卫生，性交前后进行清洗，性交后注意排尿，以预防再次出现不适症状。
总结：性生活后小便刺痛可能是性交不当损伤或疾病导致，要及时就医并注意性生活卫生来预防不适症状再次发生。