水泡脚气主要是由真菌感染引起的，治疗方法需综合多方面来进行。一般来说，通过规范的抗真菌治疗等措施，多数可以得到较好的改善。
外用药物选择
抗真菌药膏：像硝酸咪康唑乳膏就很常用，它能抑制真菌细胞膜的合成，从而发挥抗真菌作用。还有酮康唑乳膏，也可有效抑制真菌生长。这些外用药膏一般每天使用1 - 2次，涂抹在长水泡的部位。溶液清洗：如果水泡破溃有渗出，可用3%硼酸溶液湿敷，能起到清洁、收敛的作用，帮助减轻局部炎症和渗出情况。
生活护理要点
保持足部干燥：每天要勤换袜子，鞋子也要经常晾晒，保持足部处于干燥的环境，因为真菌在潮湿的环境中更容易滋生，保持干燥能抑制真菌繁殖。建议每天至少换一次袜子，鞋子最好每天更换并晾晒，让鞋子内部保持干燥通风。避免搔抓：长水泡的地方千万不能用手去搔抓，不然容易导致水泡破裂，引发继发感染，而且还可能使真菌扩散到其他部位，加重病情。如果实在痒得难受，可以通过轻轻拍打等方式来缓解。
特殊情况处理
合并细菌感染：要是水泡脚气同时合并了细菌感染，出现红肿、流脓等情况，除了用抗真菌药物外，还需要使用抗生素类药物。比如口服阿莫西林等，但使用抗生素要在医生指导下进行，因为要根据具体感染情况来选择合适的抗生素。免疫力低下人群：对于本身免疫力比较低的人，像糖尿病患者出现水泡脚气时，治疗要更积极。除了常规的抗真菌治疗外，还需要控制好血糖，因为高血糖环境有利于真菌生长，只有血糖控制好了，才能更好地治疗水泡脚气。