怀孕三个月的流产方式主要有以下几种：
一、药物流产加清宫手术：可遵医嘱服用米非司酮或米索前列醇等药物，米非司酮能将胚胎杀死，米索前列醇可促进子宫收缩，使胚胎和胎盘逐渐排出，同时需及时进行清宫手术，将残留物质清理干净，从而实现流产。
1.米非司酮：是一种孕激素拮抗剂，通过与孕激素受体结合，阻断孕激素的作用，导致胚胎失去孕激素的支持而死亡。
2.米索前列醇：能够兴奋子宫平滑肌，引起子宫强烈收缩，促使胚胎和胎盘排出。
二、引产：怀孕三个月后胎儿已逐渐发育长大且有明显骨骼，可采取引产方式流产，相对较为彻底。引产方法主要有药物引产如利凡诺引产，或使用钳刮术。
1.利凡诺引产：将利凡诺注入羊膜腔内，引起子宫收缩，促使胎儿和胎盘排出。
2.钳刮术：是用钳夹和刮匙将子宫内的妊娠产物清除。
此外，流产后一个月内要注意多休息，可适当活动，但不能剧烈运动，不可有性生活，避免劳累和熬夜。同时，饮食要清淡，避免食用辛辣刺激食物，以免影响病情恢复。
总之，怀孕三个月可根据具体情况选择合适的流产方式，流产后要做好各方面的护理。